Jihočeský kraj leží převážně na jihu Čech, ale okolím Dačic zasahuje i na Moravu; České Velenice s okolím (tzv. Vitorazsko) zase až do roku 1920 tvořily součást Horních Rakous. Na západě sousedí s Plzeňským krajem, na severu se Středočeským krajem, na severovýchodě s krajem Vysočina, na východě má kratičký úsek společné hranice s Jihomoravským krajem. Na jihovýchodě sousedí s rakouskou spolkovou zemí Horní Rakousy (Oberösterreich), na jihozápadě s německou spolkovou zemí Bavorsko (Bayern).
Okres České Budějovice je okresem v Jihočeském kraji. Jeho sídlem je město České Budějovice. Rozloha okresu je 1 638,30 km², počet obyvatel je 180 986 osoby (hustota zalidnění je 110 obyvatel na 1 km²). V okrese České Budějovice je 109 obcí, z toho 9 měst a 1 městys.
Okres Český Krumlov (Českokrumlovsko) se nachází v Jihočeském kraji. Je současně také nejjižnějším okresem České republiky. Sídlo okresu je v Českém Krumlově. S rozlohou 1 615,03 km² se okres řadí na 6. místo v republice a na 3. místo v kraji. Počtem obyvatel 60 708 se však okres jak v rámci republiky, tak v rámci kraje řadí mezi podprůměrně lidnaté (v kraji je 2. nejméně lidnatý). Dlouhá léta měl okres nejnižší hustotu zalidnění v celé republice, v posledních letech se průměrná lidnatost však díky vysokému přirozenému přírůstku zvýšila na dnešních 37,58 obyv./1 km². Českokrumlovsko je však stále 2. nejřidčeji zalidněným okresem po sousedním okrese Prachatice. Okres tvoří celkem 45 obcí, z toho 6 měst , 3 městyse a 1 vojenský újezd (Boletice). Původní obec Rožmberk nad Vltavou byla na město povýšena až v lednu 2007, stejně jako obce Besednice, Frymburk a Křemže na městyse.
Okres Jindřichův Hradec je okresem v Jihočeském kraji. Jeho sídlem je město Jindřichův Hradec. Rozloha okresu je 1 943,69 km², počet obyvatel je 92 752 osob (hustota zalidnění je 48 obyvatel na 1 km²). V okrese Jindřichův Hradec je 106 obcí, z toho 13 měst a 1 městys.
Sousedí s jihočeskými okresy České Budějovice a Tábor, s okresy Pelhřimov, Jihlava a Třebíč kraje Vysočina a jihomoravským okresem Znojmo. Jeho jižní hranice je státní hranicí s Rakouskem.
Okres Písek je okresem v Jihočeském kraji. Jeho sídlem je město Písek. Rozloha okresu je 1 126,84 km², počet obyvatel je 70 144 osoby (hustota zalidnění je 62 obyvatelé na 1 km²). V okrese Písek je 75 obcí, z toho 5 měst a 1 městys.
Sousedí s jihočeskými okresy České Budějovice, Tábor a Strakonice a středočeskými okresy Příbram a Benešov.
Okres Prachatice je okresem v Jihočeském kraji. Jeho sídlem je město Prachatice. Rozloha okresu je 1 375,03 km², počet obyvatel je 51 470 osob (hustota zalidnění je 37 obyvatel na 1 km²). V okrese Prachatice je 65 obcí, z toho 6 měst a 3 městyse.
Sousedí s jihočeskými okresy Strakonice, České Budějovice a Český Krumlov a plzeňským okresem Klatovy. Jeho jihozápadní hranice je z větší části státní hranicí s Německem, na jihu pak s Rakouskem.
Okres Strakonice je okresem v Jihočeském kraji. Jeho sídlem je město Strakonice. Rozloha okresu je 1 032,10 km², počet obyvatel je 69 539 osob (hustota zalidnění je 67 obyvatel na 1 km²). V okrese Strakonice je 112 obcí, z toho 6 měst a 4 městyse.
Sousedí s jihočeskými okresy Prachatice, Písek a České Budějovice, plzeňskými okresy Plzeň-jih a Klatovy a středočeským okresem Příbram.
Okres Tábor je okresem v Jihočeském kraji. Jeho sídlem je město Tábor. Rozloha okresu je 1 326,01 km², počet obyvatel je 102 167 osob (hustota zalidnění je 77 obyvatel na 1 km²). V okrese Tábor je 110 obcí, z toho 8 měst a 1 městys.
Sousedí s jihočeskými okresy České Budějovice, Písek a Jindřichův Hradec, středočeskými okresy Benešov a Příbram a okresem Pelhřimov kraje Vysočina.