Blanice pramení v Želnavské hornatině u bývalé osady Zlatá ve VVP Boletice ve výšce 972 m n. m., ústí zprava do Otavy u Putimi v 362 m n. m. Má délku 93,3 km. Blanice má značný spád a zejména v jarním období je bohatá na vodu. V minulosti byla využívána k plavení polenového dřeva z oblastí rozsáhlých lesů na Volarsku.
Na řece se rýžovalo zlato a lovily se zde perlorodky říční. Blanice má 95 km dlouhý tok, který odvodňuje území o rozloze 860,5 km čtverečních. Na horním úseku protéká CHKO Šumava, ale plavba není nijak omezena.
V nejhořejší části klidný meandrující tok. Od Blažejovic se prudce zvyšuje spád, balvanité koryto s přehlednými kaskádami až WW III. Nad Husincem nadržuje vodu stejnojmenná přehrada, která je rozhodující pro sjízdnost úseku pod přehradou. Od hráze až po Strunkovice svižný tok s občasnými peřejemi do WW II. Dál až do Vodňan pěkný meandrující tok s postupně se snižujícím spádem. V úseku Husinec - Vodňany velké množství jezů. Jsou to převážně staré klasické jezy s šikmou spádovou deskou, v horní části někdy i se sjízdnými propustmi. Od Vodňan převážně regulované koryto a nesjízdné jezy. Je zde řada nízkých stupňů, pod kterými se mohou tvořit nepříjemné válce.
Nejhezčí úsek: horní Nebezpečný úsek: v horním úseku jsou balvanovité kaskády, popadané stromy a obtížné jezy Obvyklý začátek a konec: Blažejovice 77.3, Záblatí 66.6, pod hrází 57.8, Strunkovice 47.1, Protivín 11.9, Putim 1.6